Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ckap2lQ7TS74 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms