Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BcanQ61361 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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