Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-203ENSMUST00000114947 2922 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sft2d1Q5SSN7 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms