Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc185Q3V118 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms