Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Znf48Q3US17 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Znf48Q3US17 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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