Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Ulk3Q3U3Q1 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Ulk3Q3U3Q1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms