Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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