Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccbe1Q3MI99 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccbe1Q3MI99 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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