Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Amn1-202ENSMUST00000111535 1457 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Prl3a1-201ENSMUST00000049463 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sox12Q04890 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms