Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl7Q03366 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms