Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms