Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Myo6-212ENSMUST00000184480 4139 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cracr2a-203ENSMUST00000212051 7625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Treml2-201ENSMUST00000170941 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Lpin3-203ENSMUST00000109456 3470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Olfr433-201ENSMUST00000052975 2406 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Klf8-201ENSMUST00000039545 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Cited1P97769 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms