Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Vbp1P61759 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Vbp1P61759 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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