Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PtpreP49446 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PtpreP49446 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtpreP49446 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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