Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tfap2aP34056 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms