Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RxrgP28705 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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