Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms