Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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