Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PdgfaP20033 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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PdgfaP20033 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PdgfaP20033 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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PdgfaP20033 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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PdgfaP20033 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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PdgfaP20033 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PdgfaP20033 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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PdgfaP20033 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PdgfaP20033 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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