Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Srp54P14576 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54P14576 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srp54P14576 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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