Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
CrxO54751 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Flna-203ENSMUST00000114299 8456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
CrxO54751 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
CrxO54751 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms