Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Dgcr6O35347 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms