Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Olfr1221-202ENSMUST00000143255 2800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ect2l-203ENSMUST00000207827 2730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ano4-210ENSMUST00000182790 4018 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 BC030343-201ENSMUST00000199606 2439 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Cpsf3-201ENSMUST00000067284 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PrkcshO08795 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pnisr-203ENSMUST00000108229 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Slc25a44-201ENSMUST00000057935 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gbp7-202ENSMUST00000171263 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Pla2g4c-203ENSMUST00000108528 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PrkcshO08795 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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