Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm17577J3QNF7 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms