Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cldn34c3J3QJW5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cldn34c3J3QJW5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cldn34c3J3QJW5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cldn34c3J3QJW5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Cldn34c3J3QJW5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cldn34c3J3QJW5 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cldn34c3J3QJW5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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