Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnf39A2RT81 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms