Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sh3bgrQ9WUZ7 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms