Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChmQ9QXG2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
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ChmQ9QXG2 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
ChmQ9QXG2 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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