Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hmgn5Q9JL35 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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