Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Usp29Q9ES63 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Usp29Q9ES63 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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