Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
MINDY3Q9CV28 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
MINDY3Q9CV28 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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