Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim3Q99PE5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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