Protein–RNA interactions for Protein: Q99M28

Rnps1, RNA-binding protein with serine-rich domain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnps1Q99M28 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Rnps1Q99M28 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms