Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Hoxc12Q8K5B8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Hoxc12Q8K5B8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxc12Q8K5B8 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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