Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pkn3Q8K045 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms