Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ercc8Q8CFD5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ercc8Q8CFD5 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Ercc8Q8CFD5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Ercc8Q8CFD5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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