Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttc27Q8CD92 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ttc27Q8CD92 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms