Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Aph1bQ8C7N7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Aph1bQ8C7N7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Aph1bQ8C7N7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Aph1bQ8C7N7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Aph1bQ8C7N7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Aph1bQ8C7N7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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