Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Rps14-201ENSMUST00000025511 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ccdc130-201ENSMUST00000005120 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Snhg3-202ENSMUST00000141090 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms