Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NischQ80TM9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NischQ80TM9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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