Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ctnna3Q65CL1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms