Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clcn1Q64347 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms