Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tspan7Q62283 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms