Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
RelnQ60841 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms