Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf3Q60765 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms