Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Ssbp4Q3U4B1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Ssbp4Q3U4B1 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms