Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Shcbp1lQ3TTP0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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Shcbp1lQ3TTP0 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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