Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Prr27Q3SYJ2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms