Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Siah1bQ06985 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms