Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Hoxd1Q01822 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Hoxd1Q01822 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms